Si la première saison se déroulait intégralement en prison, la seconde prend cette fois-ci place à l'extérieur, devenant une sorte de remake du Fugitif. Très peu de détails ont émergés sur la troisième, mais les scénaristes ont confirmé qu'ils avaient connu les pires difficultés à l'écrire. De son côté, le créateur de la série, Paul Scheuring, a affirmé qu'il renouvelait complètement le concept de Prison Break dans cette troisième saison. Les rumeurs fusent de toute part, certaines évoquant un retour en prison à Panama, d'autres annonçant une intrigue éclatée (toujours) où de nouveaux personnages internationaux viendraient se rajouter
